Första ubåtsflottiljen är Sveriges enda ubåtsförband. Flottiljens främsta uppgift är att hämta in information om andra fartyg. För att göra det används sonar, signalspaningsutrustning, periskop och radar. Första ubåtsflottiljens ubåtar har även torpeder som kan användas bekämpning av mål.
Första ubåtsflottiljen har alltid en ubåt i beredskap för att skickas ut på internationella uppdrag. Förbandet ansvarar även för Försvarsmaktens ubåtsräddningsresurs, ett fartyg och en ubåtsräddningsfarkost, URF, som kan rädda besättningen från en sjunken ubåt. Första ubåtsflottiljen finns i Karlskrona.